Investigadores de la Universidad de Sheffield (Reino Unido) creen haber encontrado formas de vida extraterrestre en la atmósfera de la Tierra tras analizar los datos obtenidos por un globo enviado a la estratosfera.
Han pasado 10 años desde que los agentes ‘J’ (Will Smith) y ‘K’ (Tommy Lee Jones) derrotaron a la malvada Seerleena. Pero, desde aquel suceso, la relación entre los agentes cambió. ‘J’ siente que ‘K’ ya no es el mismo y su intriga aumenta cuando el alienígena Boris amenaza la Tierra y lo obliga a viajar al año 1969. Allí conocerá al ‘K’ del pasado y más secretos del universo.